MYB轉(zhuǎn)錄因子

結(jié)合右側(cè)圖示:

(a)平衡二叉樹

此節(jié)點往下 左子樹深度 - 右子樹深度=平衡因子

5的結(jié)點平衡因子就是 3 - 2 = 1;

2的結(jié)點平衡因子就是 1 - 2 = -1;

4的結(jié)點平衡因子就是 1 - 0 = 1;

6的結(jié)點平衡因子就是 0 - 1 = -1;

葉子結(jié)點都是為 0;

(b)不平衡二叉樹

此節(jié)點往下 左子樹深度- 右子樹深度=平衡因子

3 的結(jié)點平衡因子就是 2 - 4 = -2;

1 的結(jié)點平衡因子就是 0 - 1 = -1;

4 的結(jié)點平衡因子就是 0 - 3 = -3;

5 的結(jié)點平衡因子就是 0 - 2 = -2;

6 的結(jié)點平衡因子就是 0 - 1 = -1;

葉子結(jié)點都是為 0;

順式作用元件:真核生物中沒有操縱子，調(diào)節(jié)基因中調(diào)控序列有許多能結(jié)合調(diào)控蛋白的元件叫順式作用元件，它們往往與結(jié)構(gòu)基因保持一定的距離。

反式作用因子:指和順式作用元件結(jié)合的可擴散性蛋白，包括基礎(chǔ)因子，上游因子，誘導(dǎo)因子。

真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是調(diào)控的最重要的途經(jīng)，大多是通過順式作用元件和反式作用因子復(fù)雜的相互作用而實現(xiàn)的。順式作用元件(cis-actingelement)存在于基因 旁側(cè)序列中能影響基因表達的序列，它們的作用是參與基因表達的調(diào)控，本身不編碼任何蛋白質(zhì)，僅僅提供一個作用位點，要與反式作用因子相互作用而起作用。啟動子存在著很多順式元件，可分為以下四種類型:①核心啟動子成分，如TATA框;②上游啟動子成分，如CAAT框，GC框，ATF結(jié)合位點;③遠上游元件:如增強子，沉默子等;④特殊啟動子成分:如淋巴細胞中的Oct(octamer)和κB。這些元件都為不同的轉(zhuǎn)錄因子及蛋白質(zhì)識別和結(jié)合來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄。

反式作用因子(trans-actingfactor)通過以下不同的途經(jīng)發(fā)揮調(diào)控作用:蛋白質(zhì)和DNA相互作用;蛋白質(zhì)和配基結(jié)合;蛋白質(zhì)之間的相互作用以及蛋白質(zhì)的修飾。參與基因表達調(diào)控的因子,它們與特異的靶基因的順式元件結(jié)合起作用。編碼反式作用因子的基因與被反式作用因子調(diào)控的靶序列(基因)不在同一染色體上。反式作用因子有兩個重要的功能結(jié)構(gòu)域:DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域,它們是其發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能的必需結(jié)構(gòu)。反式作用因子可被誘導(dǎo)合成,其活性也受多種因素的調(diào)節(jié)。同一類序列特異性的反式作用因子由多基因家族所編碼。

與轉(zhuǎn)錄水平調(diào)節(jié)的反式作用因子通常可分為四大類(RobertG.Roeder，2004):①RNA聚合酶;②和RNA聚合酶相聯(lián)系的普遍性轉(zhuǎn)錄因子(generaltranscriptionfactor，GTFs)它們結(jié)合在靶基因的啟動子上，形成前起始復(fù)合物(pre-initiationcomplex，PIC)，啟動基因的轉(zhuǎn)錄;③特異性轉(zhuǎn)錄因子(gene-specific(DNA-binding)regulatoryfactors)(如激活因子和抑制因子)，一類與靶基因啟動子和增強子(或沉默子)特異結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子，具有細胞及基因特異性，可以增強或抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄;④種類多樣的協(xié)調(diào)因子(coregulatoryfactors)，要么改變局部染色質(zhì)的構(gòu)像(如組蛋白?；D(zhuǎn)移酶和甲基轉(zhuǎn)移酶)，對基因轉(zhuǎn)錄的起始具有推動作用，要么直接在轉(zhuǎn)錄因子和前起始復(fù)合物之間發(fā)揮橋梁作用(如中介因子(Mediator))，推動前起始復(fù)合物(PIC)形成和發(fā)揮作用。包括:

1、螺旋轉(zhuǎn)角螺旋(Helix-turn-helix):有2個螺旋，螺旋2是識別和DNA結(jié)合，一般結(jié)合于大溝;螺旋1和其它蛋白質(zhì)結(jié)合。兩個螺旋由一個轉(zhuǎn)角鏈接。

2、鋅指結(jié)構(gòu):鋅指(zincfimger)這個名稱來源于它的結(jié)構(gòu)，它由一小組保守的氨基酸和鋅離子結(jié)合，在蛋白質(zhì)中形成了相對獨立的功能域，像一根根手指伸向DNA的大溝。兩種類型的DNA結(jié)合蛋白具有這種結(jié)構(gòu)，一類是鋅指蛋白，另一類是甾類受體。

3、亮氨酸拉鏈(Leucineziipper)兩個蛋白之間相互作用共同建立一個轉(zhuǎn)錄復(fù)合體，在一系列轉(zhuǎn)錄因子中發(fā)現(xiàn)的一種模體涉及兩個相同和不同的部分構(gòu)成。亮氨酸拉鏈是一種富含亮氨酸的蛋白鏈形成的二聚體模體。它本身形成二聚體同時還可以識到特殊的DNA序列。一個親水的α-螺旋在其表面的一側(cè)有疏水基因(包括亮氨酸)，另一側(cè)表面帶有電荷。

4、螺旋一環(huán)一螺旋(HLH)

5、同源異形結(jié)構(gòu)域(Homeodomains，HD):同源異形盒(hoomeobox)是一種編碼60aa的序列，長180bp，幾乎存在于所有真核生物中。